草食动物疫病重点开放实验室以牛、羊等草食动物疫病为对象，开展病原学及病原与宿主、环境相互作用规律的研究，为草食动物疫病防治提供理论依据、技术支撑和资源平台。
　　研究方向和内容：针对口蹄疫、羊痘、布鲁氏菌病、梭菌病、衣原体病、支原体病、蠕虫病、蜱传性血液原虫病等防治中的重大科学问题和技术关键，分病原功能基因组学、感染与致病机理、病原生态学、免疫机理、防治技术基础五个方向展开研究。
　　实验室积极遵循“开放，流动，联合，竞争”的基本方针，在继续保持和发展现有开放与合作工作的基础上，努力开拓新思路，加强人才和高技术的引进，以扩大实验室的知名度，促进产生在国际上有影响力的研究成果。