本项目分离到了青海马流感病毒株并采用病毒分离鉴定、血清学、病理学、动物感染试验、反转录-聚合酶链式反应、核酸序列比较分析等综合性手段，对该病毒株进行了深入的研究，证明该毒株为H3N8。经过基因组进行比较研究发现，该毒株与我国香港1992年分离毒株关系密切，血凝素基因核苷酸同源率达94%以上，神经氨酸酶基因同源率达96%以上，核蛋白基因核苷酸与欧美等国家的参考毒株同源率达96%以上，其他基因核苷酸的同源性也达90%以上，与1974年北京马流感病毒株和1989年吉林马流感病毒株明显不同。研究表明我国青海省马流感病毒分离株可能从欧洲经由香港传入大陆。同时，又将其与其他两个病毒株进行了比较。建立了该病的诊断方法，进行了疫苗制备的初步试验以及明确了我国马流感病毒在进化系统中的分子生物学地位，为我国防制马流感提供了有效的技术平台。本研究明确了我国马流感病毒间遗传演化关系，建立了马流感HI和琼扩诊断方法，并初步制备了马流感灭活疫苗。本项目研究采用方法可靠、技术先进、数据确实、结果准确。填补了我国马流感研究的空白。