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[2020]成功实现杂合二倍体马铃薯的单倍型分辨基因组分析(深圳农业基因组研究所  黄三文研究团队)

发布时间:2023-01-02
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马铃薯是世界上最重要的块茎作物。近年来,国内外相继开展了二倍体马铃薯的杂交育种,将马铃薯从无性繁殖的四倍体转化为种子繁殖的近交系杂种,加速了马铃薯的育种过程。构建马铃薯自交系和利用优良基因,需要对马铃薯基因组有深入的认识。研究团队首次解析了杂合马铃薯的单倍型基因组。通过对基因组的2套单体型序列进行比较分析,发现二倍体马铃薯内存在2万多个可能引起基因功能变化的有害突变,16.6%的等位基因存在表达差异,30.8%的等位基因存在甲基化差异。这些有害突变和差异表达基因型在2套染色体上交叉分布,使得通过传统杂交手段剔除有害突变、积累优良等位基因十分困难。这项研究全面揭示了一个无性繁殖二倍体物种的基因组特征,并为解决复杂基因组难题提供了技术思路。

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2个有害基因型- 白化基因(ws1)和株型基因(pa1)在相反的单体型上紧密连锁


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