家畜疫病病原生物学国家重点实验室依托兰州兽医研究所成立，分设病毒病、细菌病、寄生虫病和人兽共患病四个研究单元，围绕病原生态学与流行病学、病原功能基因组学、感染与致病机理、免疫机理和防控技术基础5个研究方向，开展基础研究和应用基础研究,为动物疫病防控提供科学理论与技术支撑。

       病毒病研究单元是我国口蹄疫理论创新、产品创制、技术咨询的中心，在我国口蹄疫监测和流行病学调查中发挥核心作用，O型、A型、亚洲I型单价及多价灭活疫苗是我国现阶段口蹄疫防控的主导产品。首创了口蹄疫病毒单质粒拯救系统，实现了制苗种毒的定向改造和构建，克服了自然毒株在制苗特性方面的缺陷，使抗原产量、抗原谱、免疫保护效率等得到了大幅度提升。建立了抗原设计与制备的全新技术体系，研制了病毒样颗粒、表位肽、合成肽等新型疫苗，是我国口蹄疫诊断与监测的主要产品。

       细菌病研究单元：针对“退牧还草”政策实施和集约化养殖迅速发展过程中频发的羊呼吸道疾病开展了流行病学和防控技术研究，查清了我国羊支原体肺炎的的优势病原和流行规律，创新了支原体培养工艺，提高了抗原产量，带动了羊支原体肺炎防控技术产品的升级换代，为我国现代养羊业的健康发展提供了技术支撑。

       寄生虫病研究单元：针对寄生虫病流行广泛，严重影响饲料的转化率及动物健康状况，同时，许多家畜寄生虫病为人兽共患病，可严重危害人类的生命与健康。