果树研究所是我院转企研究所之一，在科技体制改革方面确定了两步走的改革策略。
    第一步，人事制度改革。建立一套具有竞争性的人事制度。首先从试验农场开始，对原分散经营的土地实行研究所统一管理，由职工承包经营；规范农场职工待岗、内退制度，妥善分流、安置富余人员。其次，在全所推行按需设岗、竞争上岗、逐级聘任、合同管理的全员聘用制度，做到合理配置人力资源，进一步优化人员结构，建立一支结构合理、素质优良、工作高效的科技人员、管理人员和技术工人队伍，以进一步提高研究所的整体实力。
    第二步，分配制度改革。本着“效益优先，兼顾公平”的原则，进行分配制度改革。新的工资由三部分组成：即基础工资、岗位津贴、绩效工资。其中绩效工资是体现职工工作业绩和效益的部分，包括科研项目的取得、科技成果的获得、著作论文的出版与发表、科技开发创收的增长等因素。
    通过两年来的工作，研究所在转企改革中取得了较大进展。
    一、调整机构
    1、精简管理部门。将所办公室、党委办公室合并为所办公室；将科研处和开发处合并为研究发展部；将人事处、财务科分别整合为人力资源部及财务部。使所管理部门由改革前的7个精简为5个。
    2、整合科研机构设置。将原栽培研究室、品种资源研究室、植保研究室、贮藏保鲜研究室、情报资料研究室、农业部质检中心等机构，结合国家种子工程项目的建设，整合为国家苹果改良中心、国家落叶果树脱毒中心、果树种质资源创新中心、农业部质检中心、果品贮藏保鲜中心、信息中心。采取课题负责制。
    二、精简人员
    采取“按需设岗、竞争上岗、逐级聘任、合同管理”的原则，精简了富余人员。管理人员由原来的33人精简为20人；科研辅助人员由19人压缩为8人；农场由原来的69人精简为22人。
    三、实行了新的分配制度
    实行新的分配制度后，科研人员的工资增加了31%；管理人员的工资增加了19%。
    四、清产核资
    对全所固定资产及长期积累的呆帐坏帐进行认真清查，该报废的资产按规定申请报废，对债权、债务进行全面清理、登记、核对和查实。对历史遗留问题按有关政策和程序进行处理，最大限度减轻转制后的负担，为国有资产保值增值奠定了良好基础。
    五、体会
    1、要正确处理改革、发展和稳定的关系；
    2、要坚持先人事制度改革，后分配制度的改革；
    3、要坚持依法治所，按章办事。
经过改革，2002、2003年两年的平均科研经费比前三年的年平均经费增长五倍以上；科技开发有新思路，发展稳定；基础设施及条件建设取得突破。通过改革，提高了职工的工作积极性。