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[农民日报] 我国科学家解密谷子高质量图基因组

发布时间:2023-06-09 |来源: 农民日报|作者:李丽颖
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6月8日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队,通过对谷子种质资源的基因组变异和群体结构分析,组装了谷子第一个高质量图基因组,系统阐明了谷子起源及驯化改良的过程;对谷子及其野生种青狗尾草的1844份核心种质资源进行深入分析,发掘了1084个重要性状相关位点和基因,创制了谷子图基因组精准高效育种方法,为培育突破性品种提供了理论基础和技术路径。相关成果发表在《自然·遗传学(Nature Genetics)》上。

谷子是我国起源的古老作物,隶属禾本科狗尾草属,至今仍是旱作农业的主栽作物,更是应对气候变化和干旱环境的战略储备作物。其籽粒小米营养价值高,深受人们喜爱。作物种质资源是优异基因的载体,对种质资源基因组变异的系统性认识和表型性状的精准鉴定,有利于其中优异基因的发掘和利用。

论文通讯作者、作科所研究员刁现民表示,基于高覆盖深度测序,理清了谷子野生种、农家品种和现代育成品种的群体结构、分类和衍化关系,认识到谷子和水稻有着类似的基因组变异水平;群体遗传学证据清楚表明谷子单起源,全世界的谷子均来自中国。

中国工程院院士刘旭表示,我国是谷子的起源国,也保存有全世界最多的谷子资源,但系统深入的研究缺乏,限制了其遗传育种水平的提升。该研究清晰了谷子野生种、农家品种和现代育成品种三类资源的基因组变异本底,了解了三类资源的亚群分类和地理分布及其演化的可能过程,从遗传学上肯定了谷子单起源中心,即中国起源中心的理论,是利用新技术进行资源研究的典型代表。

中国科学院院士李家洋表示,此次发表的谷子图基因组研究,是杂粮领域第一个高质量图基因组。这一工作不仅是谷子研究的又一次“里程碑”式工作,也是对“小作物-大作为”的最好诠释,并将对其他作物研究具有重要推动作用。

中国科学院院士钱前表示,该研究更清晰地看到了基因组结构变异对发掘基因功能的重要性,为谷子模式植物体系提供了基因组和表型数据基础,全面提升谷子的育种水平和产量品质潜力,使我国保持谷子基础和育种研究的国际领先地位。

(单位: 中国农业科学院作物科学研究所)
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