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[经济日报]桃多组学数据库发布

发布时间:2025-07-10 |来源: 经济日报|作者:常
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近日,中国农业科学院郑州果树研究所桃遗传育种团队首次集成桃基因组、表观遗传组、群体遗传变异及多维度表型数据,并深度整合基因编辑设计与全基因组关联分析等工具,发布桃多组学数据库PeachMD。该研究为推动桃分子育种和功能基因组学研究提供数据支持。相关研究成果发表在《分子园艺(Molecular Horticulture)》上。


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当前,桃遗传育种研究产生了海量的基因组、转录组、表观遗传组等多维度数据。如何高效整合和深度挖掘这些庞大复杂的数据,是研究者面临的关键挑战。

该数据库系统整合了桃研究的多组学资源。其中,基因组方面整合12个桃基因组,支持基因组间比较分析。转录组方面汇集329个转录组数据集,涵盖不同组织与发育阶段。表观遗传组方面包含102个全基因组甲基化测序数据。群体变异与表型数据方面整合1313份桃种质资源基因组数据和关联的13类关键农艺性状表型。

该数据库不仅包含大量数据,更提供了强大的分析功能。便捷检索功能支持通过基因ID、启动子、蛋白结构域等多种方式查询基因信息。基因比较工具可以方便用户在不同参考基因组间进行基因位置转换比对。育种研究工具将基因编辑靶点设计与全基因组关联分析工具联动,覆盖从基因挖掘到分子设计育种的完整流程。数据库显著提升了数据获取与分析的效率,将有力推动桃功能基因组学深入研究和分子育种技术的加速发展。

(单位: 中国农业科学院郑州果树研究所)
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