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[科技日报] 人参完整基因组发布

发布时间:2024-05-15 |来源: 科技日报|作者:马爱平
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5月13日,记者从中国农业科学院获悉,该院深圳农业基因组研究所农业生物转录组与代谢组创新团队发表了国际首个人参端粒到端粒完整基因组,并解析了人参重要活性成分三萜皂苷的形成机制。相关研究成果日前发表于国际期刊《园艺研究》。

人参被誉为“百草之王”,具有重要药用价值。三萜皂苷是其主要活性成分之一,对中枢系统和心脑血管具有显著保护作用。论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员李伟告诉记者,人参属于遗传背景极其复杂的异源四倍体。研究团队综合应用多种测序技术,成功构建了完整性高达99.3%的人参全基因组。此外,研究人员精确鉴定了48个端粒,并预测了24个着丝粒,显著提高了人参基因组的连续性、完整性和精确度。

基于已构建的高完整性人参基因组,研究人员对人参三萜皂苷合成基因在异源四倍体形成过程中的不平衡进化进行了深入探索。研究发现,串联重复和近端重复在人参三萜皂苷的生物合成过程中扮演了至关重要的角色。同时,在人参中有一个亚基因组的基因比另一个亚基因组的基因更为活跃,存在亚基因组优势现象。

“该研究为人参的遗传研究、育种规划,筛选优质人参种质资源,以及探索三萜皂苷的生物合成路径奠定了理论基础。”李伟说。

(单位: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所)
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