根据农业部和院党组的统一部署，院直属机关党委在先进性教育整改提高阶段，针对在分析评议阶段查找出的问题，认真制定整改方案，努力在取得实效上下功夫。
一、加强理论学习，提高干部思想政治素质
　　为保证学习质量并持之以恒，党支部制定了切实可行的学习计划，并做到学习的经常化、制度化。在学习时间的安排上，拟定每周一下午为学习日。如当日因工作安排不开，即顺延安排。在学习内容及方式上，一是学习党中央、国务院、农业部和我院下发的有关文件。需要学习的文件经党委领导阅批后，列入支部学习内容。二是学习党务工作知识。首先开始学习《机关党的工作文件选编》。所学内容与哪个部门相关，即由哪个部门的同志辅导阅读，边读边议。三是交流学习工作体会。按党委内部处室及个人岗位，轮流介绍本处室及本岗位工作的有关知识，交流工作经验和体会。四是学习“我推荐的一篇文章”。以提高党员思想境界、提高现代科学管理知识水平为内容，由党委内部轮流，每次由一名同志推荐一篇文章进行学习。五是通过请进来的方式，邀请机关部门负责人和研究所的领导介绍各单位业务工作和工作经验等，请先进人物进行座谈。六是通过走出去的方式，配合当前形势教育，组织参观活动。如爱国主义教育基地、先进单位、展览等，进一步开阔视野，拓展知识。
二、建立和完善规章制度，提高科学管理水平
　　为加强直属机关党委内部建设，已经起草和正在制定《关于理论学习的有关规定》、《机关党委内部工作程序》、《关于印章的使用管理办法》、《关于机关党委经费使用的管理办法》、《关于机关党委干部学习进修的管理办法》等内部管理制度，从而使各项工作有章可循，规范管理。
三、全面规划，重点突破，进一步加强党建和精神文明建设
　　为建立保持共产党员先进性的长效机制，总结新时期我院加强基层党组织建设的方法和经验，已起草《中国农科院党组关于贯彻落实<中国共产党党和国家机关基层组织工作条例>的若干意见》。为筹备2005年第四季度召开第五次党代会，已起草《关于召开中共中国农业科学院第五次代表大会的请示》。为进一步加强我院精神文明建设，推进文化建设工作的深入开展，已起草我院文化建设工作的指导意见，筹备举办院文化建设培训班，组织开展文明礼仪知识教育活动，促进我院精神文明建设提高到一个新水平。
四、认真搞好党员个人整改
　　为切实搞好党员个人整改，在分析评议阶段，直属机关党委领导带头，党员干部之间积极开展谈心活动，广泛征求意见，认真撰写党性分析材料，从团结的愿望出发，本着“知无不言、言无不尽”的原则，组织召开专题组织生活会，党支部根据个人剖析、党员互评的情况，对每位党员进行了认真的综合分析，经过六易其稿，两次向本人反馈征求本人意见，对每位党员写出书面评议意见，提出了今后努力和整改的方向。每个党员在个人查找存在的突出问题的基础上，根据党支部评议意见和专题组织生活会上同志们的批评和建议，认真修改了党性分析材料和个人整改方案。党支部召开了专题组织生活会，交流了党员个人整改措施，党委领导带头，党员态度积极认真，整改措施切实可行，具体实在。党员同志纷纷表示，通过先进性教育，要进一步发扬长处，克服缺点，按照共产党员的标准严格要求自己，立足本职，在各项工作中起模范带头作用。